戰爭開始了。
為了能夠更快的解決戰斗，阿德尼斯開始對自己的陣營實施軍事化管理。
軍隊的制度，武器，服裝，被迅速確立。
阿德尼斯組建了正式的軍隊，自己擔任總司令官。
眼魂派開始反擊。
這取得了一定的成果，但他們很快就再次陷入苦戰。
伊迪斯和伊戈爾初開發的眼魔戰斗系統，面對改造人強大的身體，并沒有取得理想的優勢。
接著，反應過來的改造派也迅速完成了軍事化管理。
阿德尼斯正確的策略不僅沒有很快的解決戰斗，反而使得戰斗快速升級了。
究其原因，不難發現，這都是因為阿德尼斯之前的猶豫，給了改造派壯大勢力的機會和時間。
所以，面對眼魂派的全力反撲，單體實力本就比眼魂派強大許多的改造派在頂過開頭那一波兒后，很快就重整旗鼓，在丹頓的指揮下迅速反應過來，重新占據優勢。
只是，改造派的人雖然實力強大，但終究還是血肉之軀，被殺就會死。
與之相對的，眼魂派使用的只是化身，只要存放在沉睡之間的他們本體不死，那么，無論化身被殺掉多少次，眼魂派的人都不會真正死去。
因此，盡管改造派的人在戰斗中占據優勢，眼魂派陷入苦戰，但無論是哪一方，都無法徹底擊潰對方。
漫長的對峙就此開始了。
攻防戰幾乎每時每刻都在發生。
用于戰斗的武器被不斷發明出來。
雙方的廝殺破壞了建筑和街道。
原本繁華的城市變得面目全非。
接著，人心也開始變得破破爛爛。
承接無限次死亡降臨的眼魂派。
神經必須時刻保持緊繃的改造派。
結束不了的戰斗，掙扎不出的泥潭……當現實變成地獄，人們還能逃到哪里去呢？
一些人得出了結論——唯有真正的死亡才是永恒的解脫。
于是，雙方陣營都開始出現自殺者。
然后，這場漫長而殘酷的戰爭，以某個事件為界，被徹底推上了頂峰。
阿德尼斯的大兒子，
阿爾戈斯，
死了！
死于一場由改造派策劃的暗殺行動。
……
對于改造派的人來說，眼魂派的人簡直煩到了極點。
無論他們怎樣去殺，眼魂派的人都會在不久之后重新復活，再次出現在戰場上。
所以，為了能夠真正的殺死眼魂派的人，改造派在試著多次襲擊沉睡之間失敗后，便想出了“讓暗中改投改造派的人化身刺客，在沉睡之間醒來后，不急著脫離，而是留在那里暗殺眼魂派的人的本體”這一無比卑鄙和恐怖的策略。
而阿爾戈斯，就死于最初的那一場暗殺。
這給了阿德尼斯無比沉痛的一擊。
讓將改造派的人也視作重要子民的阿德尼斯的心，出現了一道無法愈合的傷痕。
……
即便處于戰爭期間，丹頓創造生命的研究也沒有停下。
然后，在持續了近百年的實驗后，奇跡終于發生了。
在丹頓，克洛伊，以及悟代的注視下。
一個男孩兒和一個女孩兒成功存活了下來。
正如之前所想好的那樣，丹頓為男孩兒取名為里昂，女孩兒取名為米昂。
在那之后，丹頓試圖創造出第二個里昂和米昂，但無一例外都失敗了。
所以，對于那兩個奇跡一般的孩子，丹頓發誓，他一定會好好保護他們，研究他們，以讓他們擁有更多的兄弟姐妹。
為此，他必須獲得這場戰斗的勝利！
然而現實，卻并沒有向著丹頓期待的方向前進。