共和國發出的警告未能起到多大的作用。
7月口日，印度國會對錫金問題討論了一整天，最終通過了一項敦促政府在必要情況下在錫金采取必要行動，以維護印度國內穩定與國家利益的法案。也就是說，印度國會不但正式授權總理采取軍事行動。還向總理府施加了壓力。
當天，印度草隊在錫金展開了針對兩支游擊隊的大規模軍事行動。
按照共和國新聞媒體的報道。印度總共出動2個師、約幼功名官兵。在甘托克、唐古、拉沖、辛古拉與辛塔姆等地進行大規模圍剿行動。為了支援地面行動，印度還出動了數十架作戰飛機與上百架直升機。派遣特種部隊深入山區，尋找游擊隊的營地，為轟炸機指引目標。
印軍大動干戈，對付的僅僅是2支總兵力不到四人的游擊隊。
面對武裝到牙齒的印度軍隊，僅有輕武器與部分輕型迫擊炮、火箭筒的錫金游擊隊只能撤入山區，利用崎嶇的地形對付圍剿部隊。
戰斗沒有多少懸念，雖然錫金游擊隊以“放冷槍”的方式干掉了幾十名印軍，但是在如此強大的敵人面前，錫金游擊隊基本上連招架之力都沒有。
戰斗進行到第三天，也就是7月舊日，錫金游擊隊基本上全線崩潰。
部分游擊隊員逃入一直在暗中支持錫金獨立運動的尼泊爾境內，也有部分游擊隊員越過唐古北面的山口進入共和國境內，更多的游擊隊員則藏起武器、混入民眾之中。以求避開印軍的鋒芒。
也就從這一天開始，印軍的掃蕩行動進入第二階段。
面對逃出錫金的游擊隊員，印軍暫時無計可施。別說越過邊境線對付逃入共和國境內的游擊隊員，就算是對付尼泊爾境內的游擊隊員。印度都得考慮由此導致的嚴重后果。印軍能夠打擊的只有那些藏在民眾中間，等到掃蕩結束后再拿起武器進行抵抗的游擊隊員。為了維護印度在錫金的利益，印軍也必須剿滅留在錫金境內的游擊隊。
殘酷的清剿行動開始。
印軍不但沒有放過錫金的成年男性，也沒有放過壯年女性。只要能夠拿起武器作戰的錫金人都在印軍的“清剿”范圍之內。按照印軍在仔日公布的政策。所有錫金成年人都要到最近的印軍駐扎地點申報情況，接受檢查。為了找出藏匿在民眾中間的游擊隊員，印軍想出了很多辦法。還動用了很多先進設備。比如，印軍動用了一批從美國引進的“炸藥檢測儀器”。該儀器不但能夠檢查出藏在地下數米出的軍火，還能發現殘留在衣物與人體上的炸藥粉末。雖然印軍對付“嫌疑犯”的態度比較文明，只要被查出接觸過炸藥的人員都被臨時看管起來，只有在確證其游擊隊員的身份之后，才移交給軍事法庭進行審判，但是印軍這么做存在著三個重大問題：一是錫金為獨立主權國家，印度沒有審判錫金反的法理依據；二是錫金本來就是山地國家，很多人都擁有用來對付野獸或者打獵用的槍支彈藥，很難界定狩獵用槍支與游擊隊槍支；三是游擊隊員身份的甄別本來就是世界性難題，游擊隊員只有在拿起武器的時候才是軍人，放下武器的時候則是平民，印度逮捕的“嫌疑犯”都沒有武器不能稱其為游擊隊員，也就沒有對其進行審判的理由。
可以說，印軍將矛頭對準錫金平民。使局勢完全喪失了轉圈余地。
對一個人口僅有數十萬的國家，印度出動了近3萬部隊，抓捕了占其國民總數近舊的“游擊隊員在戰斗中打死打傷數千人，還秘密處決了上千人，即便是暗中支持印度的美國都有點坐不住了。
7月沾日，美國國務卿布魯德林飛赴新德里。
雖然布魯德林的主要使命是為印度提供承諾，或者說為印度打氣，但是在會見魯拉賈帕尼的時候，布魯德林明確表示，印軍在錫金的行動必須有所收斂。
也就在這一天。發生了一起連魯拉賈帕尼都不愿意見到的事情。
錫金獨立斗爭黨黨魁瓦帕里在甘托克的臨時看守所內意外死亡。
雖然印度政府隨即宣布瓦帕里為了逃避法律的審判而“畏罪自殺。”但是沒有任何人相信一個為錫金獨立奮斗了數十年的革命者會自殺。
瓦帕里的死”再次點燃了錫金人的反抗斗志。
當天，甘托克發生了數起自殺式爆炸襲擊，除了導致勁多名平民傷亡之外，還炸死了數十名印度軍人。
可以說，印度此時才遇到了真正的麻煩。