“祖制以尚書、侍郎或右都御史協理京營戎政，使京營不至太過敗壞。”
“陛下改為專督京營侍郎后，卻一直沒有任命。”
“如今京營之兵，多有虛冒，新設的護軍都尉不能制。”
“請陛下任命專督京營侍郎，或者護軍都尉之上的護軍使。”
對于這個職位一直空缺，文官是很不滿的。他們不允許京營這支力量，不受文官控制。
朱由檢想到歷史上明年發生的己巳之變，覺得無論還會不會發生，京營都需要整訓，至少要有守城能力。
所以他打算嚴加整訓京營，去年任命撫寧侯朱國弼擔任神機營提督，就是在為這個做準備。
但是朱國弼整頓神機營的效果，不能讓他滿意。朱由檢思索之后，覺得還是要用文官打破當前京營的格局，遂道：
“專督京營侍郎，改為京營護軍使，兼任兵部侍郎。”
“袁卿有沒有人選推薦？”
袁可立早就和左副都御史李邦華商議過，屬意他擔任此職。李邦華聞言立刻站出，陳述治軍方略：
“京營之弊，首在虛冒占役。”
“臣以為當裁虛冒、清占役、補軍伍，使京營的士兵，能按定額滿員。”
“再則節馬差、省馬軍、煉神器、習飛石，使京營之軍，參照新軍編練。”
徐光啟練新軍的事情，京城官員多有關注。如今在訓練了數月后，漸有強軍氣象，得到很多官員稱贊。
李邦華的治軍方略，便有學習新軍之處。再加上他勇于任事，敢提出裁虛冒、清占役，這讓朱由檢頗為贊賞，說道：
“李卿在京營上用心了，這個京營護軍使，朕看你可以勝任。”
“按護軍使推舉辦法，由朝廷九卿廷推，兼任兵部右侍郎。”
把這個職位從之前需要大臣廷推的侍郎，轉為九卿廷推的護軍使，以便能更好把控，以后調換人選。
群臣因為專督京營侍郎一直以來的空缺，急著讓文官擔任此職，所以也沒有糾纏這一點。李邦華在袁可立等人推薦下，成為京營護軍使。
然后他又提議，請求從戶部、兵部、工部各派遣一員主事到京營任職，把錢糧、兵馬、器甲的事情，盡皆由文官負責。
朱由檢雖然覺得這樣或許有好處，卻還是毫不猶豫地否決。他不能讓京營的權力，完全被六部掌握。
對于失望的李邦華，朱由檢安撫道：
“京營護軍使可成立護軍司，與地方護軍府分成三署不同。護軍司仿照錦衣衛南司房，設立司務廳、職官廳、后勤廳、裝備廳、訓練廳，由護軍校尉負責，京營護軍使直管。”
“以后京營的日常事務、官員升降、編制員額、后勤裝備、訓練動員，都要經過護軍司。”