參與軍政
皇太極繼位為汗之后，與十四位貝勒議定君臣之間的禮儀，并且盟誓昭告天地。誓詞賦予代善與阿敏、莽古爾泰三位大貝勒教訓子弟的特權，他們對阿巴泰、阿濟格等十一位“子弟貝勒”，有管教之權、轄束之權，如果這些貝勒藐視代善三人，則將短命而亡。
1626年（天命十一年）農歷十月初，代善和阿敏等八位貝勒，率精兵一萬，往攻蒙古喀爾喀扎魯特部，生擒巴克貝勒父子及喇什希布、戴青、桑噶爾寨等十四貝勒，斬鄂爾塞圖貝勒，俘獲其子女人民牲畜之后返回。
1627年（天聰元年）正月初一，后金國舉行新年朝賀儀式，皇太極居中，代善與阿敏、莽古爾泰分坐其左右，四人并肩端坐殿上，接受群臣叩拜。
1629年（天聰三年）農歷十一月，皇太極親率大軍征明，岳托與濟爾哈朗率右翼軍夜攻大安口，毀水門而入，擊敗馬蘭營援兵于城下。代善和莽古爾泰夜入御帳，不許諸貝勒大臣入內，與皇太極密議說，我軍深入敵境，勞師動眾人困麻煩，即使攻入明朝邊境，也是敵眾我寡，建議皇太極立即班師回朝。皇太極雖不滿，但面對兩大貝勒的共議，又不得不做出讓步。當天深夜，岳托、濟爾哈朗諸貝勒一起給代善、莽古爾泰施加壓力，最終使代善與莽古爾泰收回成議，之后五戰皆勝。后金軍進逼明都北京，代善率領兒子岳托擊敗明朝援兵。
南征北戰
參見詞條：大凌河之戰
1631年（天聰五年）農歷八月，代善與子岳托率正紅、鑲紅二旗兵丁，參加了皇太極發動的進攻大凌河之戰，父子分領本旗兵攻城之西面。金軍圍城歷時三月，擊敗總兵吳襄等來援明兵四萬，生擒監軍張春，迫使糧盡援斷的大凌河總兵祖大壽開城投降。當時被擒各明朝官員都跪拜在地上，唯獨獨張春不跪。皇太極大怒，拉弓想要射死張春，代善勸諫說：“這個戰俘想以死成名，何必殺死他成全他？”于是，皇太極對張春置之不理。
1632年（天聰六年）年初，代善主動要求放棄自己與皇太極平起平坐的特權。在他的堅持下，皇太極最終同意將代善和莽古爾泰的座位低于自己，分別坐在他的左右。
1632年（天聰六年）農歷四月，代善跟隨皇太極討伐察哈爾，越過興安嶺之后，聽說林丹汗逃往遠處，于是后金軍轉移目標攻取歸化城，大同、宣府，與沙河堡、得勝堡、張家口諸守將議和之后返回后金國。
1634年（天聰八年）農歷五月，代善又跟隨皇太極進攻明朝，兵出榆林口，至宣府邊境外，分兵從喀喇鄂博攻占得勝堡，從朔州進取馬邑，在山西大同會師之后返回。
遭受斥責