不過隨后章曼玉又露出一絲苦笑“就是這邊的環境氣候實在是讓人有些受不了。”
吳念祖也聽人說了，這邊山地多，海拔差距非常大，800米3000米之間，而且住的地方還在兩百公里外的市區，每天趕路不僅道路非常難走，同時溫差也很大，熱的時候穿背心，冷的時候穿棉襖，這么一冷一熱的，導致劇組很多工作人員都患上了重感冒。
但這也沒辦法，老謀子就相中了這片地形和風貌，全劇組也只得聽導演的每天來回奔波，不過現在這年代不管是演員還是劇組人員都很敬業，也沒人敢叫苦，只要進組后大家都尊崇著戲比天大的原則。
吳念祖在敦煌這邊主要的戲份是四個場景。
第一個就是全身著裝大紅色騎著飛馬而來。這個紅色代表著不僅僅代表著血紅，代表著仇恨，同時也代表著蠱惑心智的虛幻，因為這一段經歷都是無名假編出來騙秦王的。
第二個就是吳念祖穿著黑色勁裝在秦軍包圍之中和章曼玉決生死，章曼玉依舊是穿著血紅色長袍。她這一段和吳念祖的比武表現氣血攻心、方寸大亂，表情間滿是悲憤之色，沒用幾招，便被吳念祖不費吹灰之力擊敗她。不過這段場景也是假的，所以章曼玉依舊是穿著紅袍。
同時紅色映照著這個故事中對于愛欲的描寫，體現著愛、恨、占有、嫉妒等激烈的人類情感，不過這一段戲份跟吳念祖關系不大，主要體現在章曼玉、梁超偉和章子藝三人之間。
第三個依舊是吳念祖在秦軍包圍之中和章曼玉生死斗，不過這次章曼玉換成湛藍色長袍。這一段兩人比武時神態就變化了，因為兩人的交手不再是紅色的血海深仇，而是藍色的大義無畏，章曼玉要表現出來的是一副決絕和慨然赴死的悲壯，吳念祖則是要面色沉重。
這段場景是被秦王猜出來的真實場景，因此章曼玉變換成水藍色服裝，藍色是憂郁和悲情的代名詞，體現了章曼玉勇于赴死悲壯的命運，同時也是縝密和智慧的顏色，象征了秦王的心智強大而鎮靜，縝密周全。
第四個，吳念祖和梁超偉在沙漠中談話，梁超偉飾演的殘劍以劍作筆，在沙地上寫下“天下”兩個字送給了無名。這里梁超偉的衣服又變成了白色，白色，代表了真相。故事到了這最后一段才揭露出事實，這才是真正劍客的面目，柔和不失凌厲，通透不失人性，信任，情義，胸懷，坦蕩如清風，高潔如皎月，白色的，才是劍客。
第五個就是吳念祖乘馬車離開的場景，離開前由章子藝這個侍女送來了梁超偉的佩劍。
從以上幾個場景中就能看出來，老謀子對色彩要求很高，每個場景中不同的顏色都是有著寓意的。在老謀子的電影中，色彩一直占有著很重要的地位，這點在英雄中表現的尤為突出。
大導演斯皮爾伯格看完英雄后就說“我不懂中文，但是通過電影中的色彩，我看懂了張一謀的英雄。”
對吳念祖來說其實打斗不難，主要要注意打斗時的微表情，當然這對他也不是多困難，重要的是那股氣質和感覺，這個才是老謀子再三要求的，不同的服飾要求表現出不同的氣質。因此吳念祖也是拍不同場景時找不同的感覺出來。
劇組在這邊拍攝了3周的時間，其實主要就是環境有點惡劣，而且要調動大批群演，一不小心出錯就要重拍，因此才拍攝這么久。
等到劇組拍攝完敦煌的戲份要收工后，眾人都不由松了口氣。接下來劇組就要分開了，分成兩組。
一組是章曼玉和章子藝，兩人跟著張一謀一起去內蒙古ejnq胡楊林，拍攝電影中非常經典的二女胡楊林打斗的場景。
另一組就是吳念祖和梁超偉，兩人奔赴九寨溝，拍攝在如鏡般的水面上打斗的場景，如果說章子藝和章曼玉打斗是唯美，那吳念祖和梁超偉打斗就是激烈。
不過因為章曼玉和章子藝怎么說也好歹是站在地上打斗的，自然要簡單一些，老謀子就先拍他們。而吳念祖和梁超偉全程都要吊著威亞在湖面上打，因此讓兩人先過去練習，等老謀子拍完這邊的戲份再趕過去拍他倆。這都是事先安排規劃好了的。