他們只是覺得，沒有想到千里入援到北京勤王，打了兩個勝仗，廣渠門的勝仗，左安門的勝仗，自己的最高統帥不但沒有受到獎賞，還被打入監獄。讓將士們寒心。
袁督師下獄后，情況急劇惡化。之前薊州放清兵入關的惡果顯現出來。清兵把北直隸禍害慘了，到處都是被殘殺擄掠的百姓，到處都是被燒殺一空的城池村鎮。
京營的士兵很多都是本地人，他們的家屬都被建奴和蒙古人荼毒，他們的財產都被搶掠一空。他們仇恨關寧軍入骨。
祖大壽的軍隊在廣渠門外，受到城上明朝軍隊的用石頭來打，甚至用箭來射，死傷了一些官兵。
祖大壽軍隊出去巡邏，白天還好，夜里頭巡邏，京營把祖大壽的巡邏的官兵抓住之后，硬是說你們是奸細，當場就給殺了。這些京營十有八九是有親人遇害，他們認為是關寧軍的責任。
只要關寧軍一接近城墻，城上一片喊罵，說你們勾引后金軍隊來，你們引敵入城，對他們進行誣蔑。
矛盾最終激化是因為，崇禎皇帝任命滿桂來接替袁督師統帥守衛北京的部隊，滿桂跟祖大壽過去曾經有過矛盾。滿桂和祖大壽是兩個系統和派別。他們當初在寧遠就矛盾很深，雙方的官兵也矛盾極深。
要不然，朝廷不會把滿桂的兵馬調走。滿桂上來后，自然要收拾祖大壽。補給錢糧也要拿一把，給他臉色看。
這種情況下，祖大壽終于不堪忍受。
祖大壽碰到重重困難，沒了袁督師，他發現他寸步難行。他越來越擔心，東林企圖搞掉他，皇帝也企圖搞掉他，把關寧軍的兵權收回來。
祖大壽思來想后，覺得再留在這里死路一條。只有回到自己的根據地去，才有生機。
于是，他開始鼓動官兵。他說，打了勝仗得不到獎賞，死了的官兵，沒有棺材掩埋，受傷的官兵得不到治療，還在露宿，留著鮮血。我們一些士兵被守城的明朝軍隊，無緣無故給殺害了。
我要向皇帝請命，讓皇帝給我們個說法。
三軍將士齊聲歡呼，可是，皇帝和內閣根本不會理會他，他算老幾呢。
袁崇煥被拘押的第三天，沒等來任何回復。
祖大壽徹底怒了，召集將領罵道：皇帝老兒居然還不肯放過袁大帥，我等還留這里給他賣命作甚，反了算了。
就這樣在群青激憤之下，祖大壽就帶著關寧軍自行撤軍，直接去了錦州。
直到這個時候，崇禎才真的慌了。關寧軍是目前最能打的一支軍隊。除了秦良玉，他能依靠的只有關寧軍了。
祖大壽的行為等于給了他一耳光。祖大壽用這個舉動告訴了天下人，你們擦亮眼睛，看清楚了，這樣的皇帝是不值得為他賣命的。
他傻眼了，這可如何是好。
他思來想去，秘密召見周延儒問計。周延儒也很頭疼，表示只有派人去監獄里找袁崇煥，說些小話，先許愿，哄騙袁崇煥寫信讓祖大壽回來一個辦法。等建奴退走了，該怎辦在怎么辦。給袁崇煥的承諾翻臉不認了就行了。
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