在滿足了人類的愿望之后，將會以最惡的方式來實現出來。
而現在，間桐櫻的身體就是通過上一次的圣杯碎片所改造的，在她的體內就隱藏著此世全部之惡
如果打開了圣杯之門，那么不折不扣的惡魔就會被釋放出來。
他們現在的目的就是要阻止櫻。
接下來已經黑化了的間桐櫻襲擊了衛宮宅，并且帶走了伊莉雅。
間桐櫻之所以要帶走伊莉雅，最主要的原因是伊莉雅是小圣杯，也就是點燃大圣杯的容器。
幸好在言峰綺禮的幫助之下，衛宮和言峰綺禮一起闖進了愛因茲貝倫城堡當中將伊莉雅給救了出來。
游戲進入到了最后的大決戰，來到了尾聲。
為了對抗現在已經吸收了眾多魔力變得無比強大的櫻，眾人商量決定，去往遠坂家當中尋找寶石劍。
這是遠坂家所繼承的限定魔術禮裝。因為劍刃的部分看起來像具有多角面的寶石，所以被稱作寶石劍。
這劍盡管是限制性卻有著第二魔法“平行世界的運營”的能力。
如果使用這個力量，將充滿于平行世界大氣的魔力拿來這邊也是可能的。
從某種意義上來說，寶石劍可以無限的魔力。
之后衛宮士郎在依莉雅的幫助下調查了遠坂家內部有關第一次圣杯戰爭的記錄，并看到了寶石劍的原型，從而借助英靈紅a的手臂勉強投影出了寶石劍。
雖然是個劣質品，不過功能依然十分強大。
凜剛得到了寶石劍，門的外面，櫻的影子就追了過來。
但是，出人意料的是
櫻卻是讓凜帶著衛宮士郎一起逃跑的，這樣她才能放心和安哥拉曼紐同歸于盡。
玩到這里，山田正治表示，我真的是哭死。
櫻這樣的女孩子，從小就飽受欺凌，按理說她應該憎恨遠坂凜才對，卻沒有想到她到最后依然還是如此的善良。
換成是他的話，搞不好已經要毀滅這個世界千萬次了。
在大地圖當中，多出來的地點，就是最后圣杯出現的位置。
只不過這個圣杯內部應該是被污染了的，充滿了邪惡力量的惡魔。
眾人為此展開了決戰。
先是在道路上面遇到了間桐臟硯和他的隱匿者。
言峰綺禮使用了圣言術，將他們一一擊敗，同時直接按住間桐臟硯的腦袋，讓他無法逃跑。
在圣言過后，間桐臟硯的整個身體也隨之飛灰湮滅了。
不過，對于他來說，這一切并不是終點，只要有一只蟲子還活著，那么他就還是能夠復生的。
而那只蟲子就寄生在櫻的身體當中。
眾人見到櫻的時候，她正毫不留情地將體內的蟲子給掏了出來，用力碾碎。
間桐臟硯就此也算是徹底完蛋了。
只不過，衛宮士郎他們接下來要面臨的戰斗卻更加的艱巨和可怕。
言峰綺禮在櫻的攻擊下，直接當場死亡，變成了一個沒有心跳的行尸走肉。
而與此同時，衛宮士郎跟伊莉雅正在聯手跟黑化了之后的狂戰士赫拉克勒斯進行著殊死的戰斗。
為了擊敗他，衛宮迫不得已使用了封印的紅a的英靈手臂，投影出赫拉克勒斯的斧劍之后，整個人的戰斗力也隨之暴漲。
擊敗了赫拉克勒斯之后，他的臉上露出了欣慰的笑容。
狂戰士在這一刻終于解脫了，而且他從一開始就相信，衛宮士郎一定能保護好伊莉雅的。
在打敗了赫拉克勒斯之后，它的能量也快速回到了櫻的身體當中。
毫無疑問，現在的櫻就是那個容器。
很快，再7個英靈都回收之后，她將徹底變成圣杯，然后釋放出安哥拉曼紐，那個世間之惡。
留給眾人的時間都不多了。
可是，下一個對戰的對手，卻是讓山田正治非常揪心的
黑saber。
被黑化了之后的saber，擁有著強大的魔力，幾乎是用不掉的魔力，而她的每一次攻擊，哪怕是簡單的魔力放出，都足夠讓他們團滅。
偏偏這還是一場必須勝利的戰斗，所以山田正治打了好久，才終于通過美杜莎的魔眼，控制住了黑saber一回合。
在這一個回合當中，所有的大招全部招呼上來，非常幸運的是這一次沒有觸發黑saber的閃避，直接將她那為數不多的血量給清空。
轟
戰斗勝利之后。
進入到了過場動畫當中。
黑saber跟兩人的正面對決，她將手中的黑色長劍握緊，與此同時，站在她對面的衛宮也解開了綁在左手上面的封印。
他將手腕平平舉起，向著黑saber的方向
“吾身為劍所鑄，血潮為鐵，跨越無數戰場而立于不敗之地
熾天覆七重圓環”
而與此同時，黑saber也放出了寶具
“excaibur”
巨大的力量沖擊而過，卻被衛宮士郎擋了下來。
在士郎的身后，雖然已經身負重傷，不過美杜莎依然釋放出了自己的寶具