在文化上，西方人嘲諷華夏的文化是封建迷信色彩濃厚，這其中就包括中醫。
在西學東漸的過程中，西醫，或者說是現代西醫，以強勢的姿態入侵華夏，在列強與教會的支持下落地生根。
從那時開始，中西醫論爭日益激化。
醫界相當一部分人認為中醫已落后于時代，是封建迷信的騙人把戲。因此從道光皇帝、北洋政府，到國黨、光頭，都曾制造各種障礙阻止中醫的發展，甚至企圖用行政手段消滅中醫。
其次是1912年，北洋時期的政府故意把中醫藥排斥在醫學教育系統外，這就是近代史上著名的“教育系統漏列中醫案”。
1913年，教育總長汪大燮公開提出廢除中醫中藥，在接見京師醫學會代表時毫不掩飾地說“余決意今后廢去中醫，不用中藥。所請立案一節，難以照準。”接著，在教育部公布的教材中，繼續把中醫摒于政府教育體系之外。
1922年3月，北洋政府內務部頒布了管理醫士暫行規則，出臺了種種摧
殘中醫醫生、束縛中醫醫學的條款，受到中醫界的強烈反對。上海中醫學會迅速行動起來，各地紛紛響應，派出代表赴南京請愿，內務部被迫宣布暫緩實施醫士規則。
提到“反中醫”，不得不提一個遣日留學生，余云岫。
余云岫自幼學醫，原本是學著傳統中醫，在潯溪公學學習長大的。
小時候，他的老師用清朝已經比較系統化的醫書和儒學教育他長大
“內經本草經記會了嗎”
“記會了。”
“不對，該打”
“傷寒論學會了嗎”
“學會了。”
“嗯，還行”
長大后，因為余云岫的出眾，得到了公費出國留學的機會，這個留學的地點就是在日本。
當余云岫來到日本，首先被當時已經進入現代化的城市和學校震驚了。
“這就是日本”余云岫在現代化的城市面前感到自卑，急于在這里尋找自己熟悉的東西，找到自己的日本同學攀談，“聽說日本也有中醫”
“哦，你說的是漢醫吧，我們早不學了。”日本同學輕蔑地一笑，“漢醫是落后的醫學，已經被我們廢除了。你還在學嗎”
“沒有沒有我們也不學了”余云岫被說得臉紅，連忙否認。
但是日本同學不相信，嘲諷一笑，意有所指打量著他瘦弱的身體“難怪這么瘦弱，嘖。”
余云岫受到刺激，越發覺得自己祖國的醫學落后。
當他接觸到從未見過的西洋醫學時，和自己學過的中醫一對比，更覺得中醫相形見絀。
他暗暗下定決心“我要回去改革醫學”
于是，當余云岫學成歸國，第一反應不是將自己所用到華夏醫學，而是全面否定自己祖國的醫學。
回國后的第二年，余云岫著書靈素商兌一書。
這是一本全面批判和否定中醫的奠基著作，余云岫也成為了最早提出“反中醫”和“廢禁中醫”觀點的代表人物。
在書中，余云岫把中醫批得一無是處，說中醫“無明確之實驗，無鞏固之證據不問真相是非合不合也”，說中醫“是占星術和不科學的玄學”，聲稱“不殲內經，無以絕其禍根”。
余云岫一直鼓吹中醫是“殺人的禍首”，主張“堅決消滅中醫”，“如不消滅中醫，不但妨礙民族的繁息、民生的改良”，而且國際地位的“遷善”也無從談起；“舊醫一日不除，民眾思想一日不變，新醫事業一日不向上，衛生行政一日不能進展”。
開始時，余云岫的名氣不大，他的言論沒有多大影響。