原本小智是打算攻破了對戰宮殿后就前往神奧地區挑戰下一個開拓區道館的，可秘密小島上的四根神秘石柱，卻讓小智改變了想法。
“哥哥，不是打完了嗎，為什么還要留在這里啊。”看著小智在四根神秘石柱的中心左看右看，白很是無聊的開口問道。
“這些石柱上的符文不是簡單的東西，雖然我已經復制了下來，但有些東西還是要看實物比較準確。”小智頭也不回的回應道，然后繼續摸著其中一根石柱上的符文。
數月前，在東半球最邊緣的某個極冰之地，世界著名的倫多博士，正帶領著自己的團隊在這里進行某種
神秘的探索。
倫多博士，是研究外太空神奇寶貝的專家，曾經找到過很多有關于外太空存有神奇寶貝的證據，就算是小智的外公大木博士，在有關外太空神奇寶貝的研究上，也有所不及。
數月前，倫多博士正利用世界最先進的天文望遠鏡觀察口袋星周邊的太空，神奇寶貝世界的星球叫做口袋星，這也是小智前不久才知道的。
原本只是一次照常的觀察，可倫多博士卻發現了一顆隕石正在逐漸接近口袋星，而且根絕分析，這塊隕石絕對會降落到口袋星的某個位置上。
一塊隕石并不能讓倫多博士有什么特殊的反應，畢竟隕石的出現已經不是第一次了。
在把這件事情上報給聯盟之后，聯盟的高層為了防止隕石撞擊口袋星會造成難以想象的破壞，于是決定用導彈摧毀那塊即將撞擊口袋星的隕石。
很快，一枚導彈從芳緣聯盟的軍事基地中發射了出去，撞擊上了那塊神秘隕石，但令所有人都沒有想到的是，那塊隕石竟然絲毫未損，這種情況在以前可以說從未出現過。
于是乎，聯盟的又再次發射了數顆導彈，但結果始終都是一樣，完全無法摧毀掉隕石，這個發現，讓聯盟的人有些頭疼。
以往，針對這種隕石撞擊口袋星的事情，所有地區的聯盟幾乎用的辦法都一樣，用導彈解決掉，如果說隕石撞擊的地方沒有任何生命的存在，那么聯盟也不會去破壞掉，畢竟隕石也是一種很值得研究的東西。
但是這次很明顯不行，因為這塊隕石撞擊的地點極冰之地，是很多冰系水系神奇寶貝的棲息地，一旦被破壞，可能會造成海嘯，甚至改變那附近的氣候。
當時，軍事科學家們根據探測，分析出那塊隕石撞擊口袋星的時間還有一個多月，所以趁著這個空檔，聯盟想出了很多的方案，但都沒有效果。
后來倫多博士知道這件事情后，也對這顆被自己發現的隕石產生了興趣，利用高科技的手段，讓聯盟把小型分析儀裝在了導彈上，在下一次發射的時候，可以掃描那塊隕石