少時，公孫長青父母便外出歷練，多年未歸。后來，兩人點在家族祠堂里面的魂燈也不知所蹤，生死不知。留他一人自小與祖父相依為伴，只是因為公孫鶴身為族長，家中庶務繁忙，常常無法顧及他。
而族中大長老公孫蘭一脈野心勃勃，騙取公孫鶴的信任。以自已是女子能更好照顧家族繼承人為由將公孫長青帶他在身邊。表面上對他悉心教導。暗地里卻偷偷給他下毒，毀他靈根，陷害嫡系子弟，妄圖他們這一脈的后人在日后能取而代之，掌控家族資源。待公孫鶴有所察覺，她已羽翼豐滿。
公孫鶴只能不動聲色，虛與委蛇。暗地里卻偷偷尋找治療孫兒的契機。
后來，機緣巧合，他在秘境藥王神廟中收獲藥王令和一本醫書，以及一份記載《養生訣》的玉簡。而此時的長青因為靈根受損，便也開始自已學醫自救并開始修煉武者心法《養生訣》。
公孫鶴便索性把醫書、養生訣的玉簡以及藥王令一股腦全給了長青，并叮囑他好生收著，因為那藥王令雖然他研究多日未果，但依舊讓他覺得不同尋常。
而他自已對于公孫長青，這一唯一的血脈后人，始終不甘放棄，繼續尋找幫他修復靈根的靈物。終于功夫不負苦心人，他找到了！雖然他早作防備，本想以帶著公孫長青出門歷練為由，偷偷為他修復靈根。不料，卻消息泄露，一路遭大長老一派的人連續追殺。
甚至為威逼他交出寶物，那些人還對長青進行了搜魂。危急關頭，公孫鶴匆忙之下激發傳送符，卻陰差陽錯，兩人在傳送過程中分開了。他用血脈之術只推算出長青在凡俗界，他追蹤到此，先依他以往習慣開辟洞府，后為屏蔽大長老派系的追殺，也為公孫長青贏得生機，他不得已施展禁術，卻傷重不治，就此含恨隕落此地。
而他還始終牽掛不知所蹤的公孫長青，在此石室中憑著一股執念在此地設置血脈感應陣法，并留下最后一道神識。
后來的事，清樂便大膽推測，遭遇搜魂后的公孫長青淪落到凡俗界后，卻不知為何沒有癡傻，只是記憶缺失。憑著一身生死人肉白骨的神秘醫術和武者心法《養生訣》，很快在江湖上站穩腳跟，并一手創立了“藥谷”。從此，”藥老”名號響徹江湖，“藥谷”也聲名鵲起。
“長青，祖父能見到你安然無恙也就安心了。那石桌上的儲物戒中有祖父的收藏。里面有九品解毒丹，你可以服下解了黑炭之毒。只是可惜……不知是哪個小賊竟將我為你找來的先天靈水全部取走！導致你恢復靈根無望！”公孫鶴說到后面語氣森森。
一旁的小賊=徐清樂聽得一呆：……
“祖父，萬物皆有定數，一切都是最好的安排。咳咳咳咳……您不必介懷。”藥老瞥了一眼呆愣的小徒弟，哪有什么不明白的。不過，至少肥水不流外人田，好東西沒便宜了旁人。藥老表示很滿意自己目前的狀態，他覺得做個普通凡人沒什么不好。
“來，樂兒，見過老祖！”藥老招呼徐清樂給老祖見禮，又對著公孫鶴擺出一臉笑，說道：“老祖，這是孫兒在凡俗界收的弟子。她是火木雙靈根。您給指點指點……”