與忍者學校空泛的內容不同，暗部的課程可謂是干貨滿滿。
想要真正的成為暗部，足足有12門課程需要精通。
忍界情報篇：各個血跡忍族、秘術忍族、還有各個忍村知名的強者、影、忍界特殊尾獸，這些都有一個小冊子需要記住。
暗部守則篇：作為森嚴的軍事組織，它的行動規則與組織紀律需要牢記。
劍道篇：不論你是什么類型的忍者，加入暗部必須學會使用忍刀近戰。
特殊手段篇：暗部奔赴在戰斗一線，有時敵情如火，必須要有及時的處理，基本的封印術、醫療忍術應急手段必須要有，帶不回活口斬下腦袋又如何封存、中毒如何處理。
暗號篇：作為秘密部隊，你需要能看懂自家密文書寫的任務簡報，并且在得到他人情報時擁有破譯手段，知道暗號走在戰場上才不會被自己人解決掉。
拷問篇：如果你不是山中一族的忍者，那么最好學一兩門拷問手法，這會讓你在關鍵時刻獲得情報，并且讓自身免受損失。
被拷問篇：忍者的任務中，失敗被俘是常有的事，如何在被人抓住的時候想辦法脫困，如何頂住壓力，在死前守住情報，這是一門學問。
野外生存篇：不想莫名吃了什么東西不舒服，導致任務失敗的人，都應該好好學習這門課程，知道什么掐頭去尾是雞肉味，什么掐頭去尾還是很惡心。
偽裝篇、潛入篇、追蹤篇、陷阱的布置與偵查。
要是說正常的忍者其實是披著忍者皮的戰士，那么暗部就是真正符合忍者定義的暗殺戰術特殊部隊。
“千玨！”
“到！”
“暗部守則第三條！”
“身為暗部要有‘我的良心和軟弱已經賣給木葉了’的覺悟！”
“很好，坐下！”
“是！”
……
“千玨！”
“到！”
“偽裝的時候需要注意什么？”
“化妝術永遠比變身術好用！”
“很好，坐下！”
“是！”
……
“千玨！”
“到！”
“651！%#%#￥431*-+assrgavrw？”（暗號）
“&**（）…………￥%￥%#（）暗號）
“Nice，sitdown！”
“是！”
……
“千玨！”
“是！”又站起的阿卡麗有些無奈。
“與輝夜忍者交戰那些需要注意？”
“報告！沒覺醒尸骨脈的輝夜正常處理，覺醒了尸骨脈的輝夜身體很硬，每個部位都能延伸刺出骨刺需要小心，并且他們的骨頭刀比一般忍具都要鋒利，需要小心對抗。”