對于這個世界來說，葉赫的實力實在是太強了，他們不要說阻止葉赫了，除了剛開始的綾波麗之外，其他人根本就無法發現葉赫的存在。
一直到渚薰，也就是亞當的意識，第十七使徒，才再次發現了導致這一切的罪魁禍首到底是什么人。
不過很可惜，一切都已經遲了，因為劇中的主要任務，除了碇源渡之外，已經全部被葉赫收入自己的世界之中了。
明日香，葛城美里，赤木律子等等，甚至初號機，三號機這些EVA都全部被葉赫收進自己的世界之中了。
而唯一沒有被葉赫收進自己世界的碇源渡，現在他已經要瘋了，因為他的計劃徹底失敗了，甚至就連那些復制體都被銷毀了。
而最底層之中的莉莉絲，要不是葉赫還要用她來吸引其他的使徒過來，葉赫恐怕連莉莉絲都收走了。
碇源渡之所以現在還沒有真瘋，是因為他的手中還有一個亞當，而只要亞當跟莉莉絲的身體還在，他就還有翻盤的機會。
所以現在他已經瘋狂了，正在不計一切代價的制造EVA，并且還在試圖將綾波麗復制出來。
可惜的是，綾波麗身體之中莉莉絲的靈魂都被葉赫剝離了，就算他能重新制造出綾波麗的身體，這個復制出來的‘綾波麗’也不可能動起來的，因為它就只是一個沒有靈魂的‘玩偶’罷了。
不過碇源渡即便是這樣，他依然沒有放棄，而是重新選擇了另一個目標，他居然喪心病狂的想要利用第三使徒來讓綾波麗復活。
很可惜的是，他失敗了，而且初號機也沒有了，所以他放棄了讓自己的妻子成神，也就是初號機成神的想法，他決定自己成神。
他想，只要他成神了，那或許他還能找到自己的妻子碇唯，所以他讓加持將亞當帶回來，并準備將亞當移植到自己的身上。
很開心的是，葉赫早就已經等候多時了。
在加持進入基地的那一瞬間，葉赫就通過空間之力將亞當拿走了，因此當碇源渡焦急而興奮的打開那個原本裝有亞當的箱子時，看到的卻是一個空空如也的箱子。
將亞當收走之后，使徒開始出現，不過很可惜的是，原劇之中讓主角多出經歷生死危機的使徒在面對葉赫的時候卻沒有絲毫的還手之力，一個個全部被葉赫收入了體內世界。
當最后一個使徒，也就是莉莉絲也被葉赫收入體內世界之后，這個世界又重新恢復了平靜，而碇源渡也從權傾一方，掌控一整個基地，甚至掌控整個人類存亡的存在成為了一個被冷落的無權小將。
當最后一個使徒都被葉赫手中之后，他的計劃就已經徹底失敗了，人類補完計劃自然也失敗了，所以碇源渡被踢走了。
再加上他的計劃全面失敗所收到的打擊，碇源渡變成了整日飲酒度日的酒鬼，不過這跟葉赫都沒有任何的關系了，因為他已經開始控制小世界吸收這個世界了。
將所有的使徒都收入自己的體內世界，世界樹將這些使徒所蘊含的本源跟殘缺的世界意識之后，世界樹再度結出了一枚世界種子。